CENTER FOR BRAIN SCIENCE

BMA

Support Unit for Bio-Material Analysis

遺伝子多型解析

サービス概要

遺伝子多型解析サービスでは、フラグメント解析とジェノタイピングの2種類の解析を提供しています。フラグメント解析では蛍光標識DNA断片を高精度に解析可能です。ジェノタイピングでは、生体試料からのゲノムDNA抽出・PCR・電気泳動（分解能はアガロースゲル電気泳動相当）までを一括または工程別に実施しています。

サービス内容

フラグメント解析

Thermo Fisher Scientificの遺伝子解析装置3730xlを用い、蛍光ラベルされたDNA (PCR増幅や制限酵素処理されたDNA断片)を電気泳動し、移動度やサイズを検出します。得られたデータは、ThermoFisher ScientificのGeneMapper®もしくは、PeakScanner™ソフトウェアにて閲覧することができ、DNAサイズを見る場合は数塩基の差まで判別可能です。

＜主な解析例＞

• マルチプレックスPCR解析：複数種類のプライマーセットで増幅されたPCR産物の解析
• 繰返し配列（マイクロサテライト）解析
• 一塩基多型（SNP）解析
• 末端制限酵素断片長多型（T-RFLP）解析：細菌叢の特性評価など

ジェノタイピング

前処理として、マウス、ラット、ゼブラフィシュ等の生体試料（尾や耳など）からゲノムDNAを抽出・精製 (�@ゲノムDNA抽出) 、そのサンプルを用いて標的DNAの増幅反応 (�APCR) まで行います。解析としてQIAGENのQIAxcel Connectを用いてPCR産物の検出 (�B電気泳動) を行います。蛍光標識DNAであれば希望により3730xlでの解析も行っています。各ステップのみの依頼も受け付けています。

＜主な解析例＞

• ゲノムDNA抽出

  Agencourt DNAdvance Kit (ベックマン・コールター) を使用し、マウス尾などの生体試料からゲノムDNA抽出を行います。他のキットで溶解したサンプルからの抽出は対応していません。

• PCR*

  指定されたプライマーと反応条件で目的DNA断片を増幅します。

• 電気泳動*

  QIAxcel Connectをもちいて増幅DNA断片の泳動を行います。

* 解析条件が定まっていない場合は条件検討も行っています (有償)

使用装置

3730xl (Thermo Fisher Scientific)

Biomek i7 (Beckman Coulter)

QIAxcel Connect (QIAGEN)

• 3730xl / Thermo Fisher Scientific : フラグメント解析
• Biomek i7 / Beckman Coulter : ゲノムDNA抽出
• ProFlex / Thermo Fisher Scientific、Biometra / Analytik jena : PCR
• QIAxcel Connect/ QIAGEN: 電気泳動

サンプル送付方法

郵送　もしくは　直接持ち込み

提出サンプル

• フラグメント解析：蛍光標識されたDNA（遮光・冷蔵）
• ゲノムDNA抽出：マウス等の生体試料（冷蔵または冷凍）
• PCR：鋳型DNAと10μMプライマー、それぞれ5μL（常温または冷蔵）
• 電気泳動：DNA 10~20μL（常温または冷蔵）

納品

解析データ：解析ファイルをクラウドストレージBOX経由で納品
（フラグメント解析は.fsaファイル、ジェノタイピングはPDFファイルとなります）

抽出サンプル：クール便で郵送（着払い）

注意事項

• 受領した解析データについては、速やかに内容をご確認いただき、依頼者の責任において適切に管理してください。
• 本サービスでは、原則として解析データを 5 年間保管 いたします。ただし、データ消失を防ぐため、依頼者側でのバックアップ取得を強く推奨します。保管期限を過ぎたデータは、責任をもって消去いたします。
• お預かりしたサンプルは、原則返却いたしません。
• 解析データの解釈および最終判断は、利用者の責任にて行ってください。
• 指定された PCR 条件で実施した解析に関する再解析は、有償での対応となる場合があります。

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