CENTER FOR BRAIN SCIENCE

BMA

Support Unit for Bio-Material Analysis

質量分析：プロテオーム解析

サービス概要

nanoLC-MS/MS（Orbitrap/Tribrid型質量分析計）システムを用い、網羅的タンパク質同定から翻訳後修飾解析、比較定量解析まで研究目的に応じたプロテオーム解析を提供します。

解析内容

• 網羅的タンパク質同定（Data-dependent acquisition, DDA によるグローバルプロテオーム解析）
• 各種修飾解析（アセチル化、メチル化、リン酸化、ユビキチン化、脂質修飾などの翻訳後修飾、蛍光標識、化学修飾など）
• 多検体間の比較定量解析

  安定同位体標識法：iTRAQ/TMT、SILAC、¹⁸O
  ラベルフリー法：DDA、Data-independent acquisition, DIA

• タンパク質間相互作用および複合体解析（免疫沈降などのアフィニティ精製法、近位依存性ビオチン化法、クロスリンク法）

• 組織、培養細胞、血液や脊髄液を含む体液など、さまざまな生体試料のプロテオーム解析に対応可能です。
• サンプル調製について：原則として依頼者にて実施をお願いしておりますが、研究目的やサンプルの特性に適した手法については、事前の打ち合わせを通じて技術的なアドバイスを行います。
• 解析範囲について：当方では LC-MS/MS 測定、およびタンパク質の同定・定量を含む基本的なデータ解析までを承ります。その後の統計解析や生物学的解釈については、依頼者にて実施いただくことを標準としています。

使用装置

• Vanquish Neo nano-UHPLC + QExactive Orbitrap 質量分析計 (Thermo Fisher Scientific)
• Vanquish Neo nano-UHPLC + Orbitrap Eclipse Tribrid 質量分析計 (Thermo Fisher Scientific)

QExactive

Orbitrap Eclipse

解析例

マウス大脳皮質（CTX）および小脳（CER）のタンパク質発現比較解析 [DIA法]

DIA 法では低存在量のペプチドも効率的に捕捉可能であり、マウス大脳皮質および小脳由来サンプル各 100 ng から、約 7,000 種類のタンパク質を高感度に定量できます。

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