CENTER FOR BRAIN SCIENCE

BMA

Support Unit for Bio-Material Analysis

次世代シーケンス解析

サービス概要

次世代シーケンサーMiSeqを使用した、小規模シーケンスを行う。
また、次世代シーケンスに使用するライブラリの作製も行なっている。

• Miseqを用いたシーケンス解析

  申込者が作成したIllumina用シーケンスライブラリーをMiseqでシーケンスを行う。
  Miseqでクラスター形成、シーケンス、FASTQファイル作成をする。

• 前処理(ライブラリ作製)

  各社ライブラリプレップキットを用いて次世代シーケンス用ライブラリー (Illumina用) を作製する。様々なアプリケーションに対応している。
  提出サンプルは精製済みDNA/RNAのみです。

  実績例:

  • Whole Genome :
    Illumina DNA PCR-Free Kit (Illumina), TruSeq DNA Prep Kit (Illumina)
  • Exome:
    SureSelect (Agilent), HaloPlex (Agilent), Twist (Twist)
  • ChIP-Seq:
    TruSeq ChIP Library Prep Kit (Illumina)
  • Methyl-Seq:
    SureSelect Metyl (Agilent)
  • RNA-Seq:

    TruSeq mRNA Prep Kit (Illumina), Illumina Stranded Total RNA Prep Kit (Illumina), SureSelect Strand-Specific RNA (Agilent), SMART-Seq mRNA (TaKaRa), SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing (TaKaRa), NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep (NEB)

  *使用するキットは申込者の方で用意してください。

• NGS Library 定量

  KAPA Library Quantification Kitを使用して NGSライブラリを定量する。

• Bioanalyzerを用いたライブラリQC

  Agilent社Bioanalyzerを用いてライブラリQCを行う。

使用装置

MiSeq (Illumina)

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