生体物質分析支援ユニット

理化学研究所
脳神経科学研究センター研究基盤開発部門生体物質分析支援ユニット

RIKEN CENTER FOR BRAIN SCIENCE
RESEARCH RESOURCES DIVISION
Support Unit for Bio-Material Analysis

ABOUT

生体物質分析支援ユニット (BMA) は理研脳神経科学研究センター（CBS）のコアファシリティーとして、CBSのみならず理研全体に広く技術支援を行っています。また2025年度よりTRIP外部共用・基盤研究支援制度*を通じて、理研外の研究者にも生命科学に関する様々な支援（受託解析）の提供を開始しました。

主な技術支援項目：
サンガーシーケンス解析, 遺伝子多型解析, 遺伝子微量定量解析, 質量分析, プロテオーム解析, 低分子定量解析, ペプチド合成, タンパク質精製, アミノ酸分析, フローサイトメトリー, 次世代シーケンス解析など

専属の技術者を配置し、多様な技術支援を提供: ラボから依頼された細胞および生体物質（タンパク質・核酸・アミノ酸など）の分析・解析やペプチド合成などを技術支援として提供します

サンガーシーケンス解析

植菌済みの培地を受け取り後、一晩培養し、アルカリ-SDS法またはシリカメンブレン法でプラスミドを抽出。抽出したプラスミドやPCR産物をテンプレートに、サイクルシークエンス反応を行う。GCリッチ配列に対するアルカリ処理や、PCR産物のExoSAP処理にも対応。反応後は磁気ビーズで余分なDyeを除去し、DNAアナライザー（3730xl）でシークエンス解析を行う。
遺伝子多型解析

フラグメント解析に必要な前処理から解析まで対応します。市販のキットを使用して、マウスやラットの尾や耳、セブラフィッシュの尾、ヒトの爪などからゲノムDNAを抽出。次に、蛍光標識プライマーを用いたPCRで目的のDNA断片を増幅します。増幅されたDNA断片は、Applied Biosystems 3130xl または 3730xl DNAアナライザーで泳動・解析を行います。さまざまな生物種・サンプルに対応可能。
次世代シーケンス解析

Genome DNAからExonなど解析に必要な部分を濃縮し、次世代シーケンス用ライブラリー(Illumina用)を作製する。Whole Genome、ChIP-Seq、Methyl-Seq, RNA-Seq、1細胞シーケンス[Quartz-Seq2]等のアプリケーションにも対応。Illumina用シーケンスライブラリーをMiSeqを用いてクラスター形成、シーケンス、FASTQファイル作成を行う。打ち合わせからQCまではRRDで行い、NovaSeq、HiSeq Xに対応したシーケンスは外部委託する。
遺伝子微量定量解析

TaqMan AssayおよびSYBR Green Assayに対応したPCR解析を行う。cDNAまたはgDNAサンプルに、プライマーやプローブ、Master Mixを混合し、PCR反応によって遺伝子の発現量を測定。また、cDNAサンプルと2種類のプローブを用いた反応により、SNP（一塩基多型）検出にも対応。さらに、利用者が作製されたプライマーセットについては、非特異的産物の有無や最適な濃度条件の検討も可能。
ペプチド合成

自動ペプチド合成装置を用いて固相合成法によりペプチドを合成し、品質は逆相液体クロマトグラフィーおよび質量分析（MALDI-TOF/MS）で確認します。粗ペプチドや精製ペプチドを提供し、ペプチド精製のみの依頼にも対応可能です。キャリアタンパク質を用いた抗原ペプチド作製、N末端（Free、Ac、Fmoc等）やC末端（Free、NH2、Resin等）の修飾も行います。さらに、長鎖ペプチドやビオチン化、蛍光化、環状化、非天然アミノ酸を含むペプチドも合成します。
質量分析: プロテオーム解析

MALDI-TOFやESI-Orbitrap型質量分析計を使用し、低分子化合物からタンパク質までの幅広い化合物の質量測定を行います。低分子化合物の定量には、LC-MS/MSを用いたMRM法で高感度かつ選択的に定量します。プロテオーム解析では、nanoLC-MS/MSを用いてタンパク質の同定や翻訳後修飾解析を高精度で行い、比較定量解析やタンパク質間相互作用解析にも対応します。
質量分析: 低分子化合物定量解析

MALDI-TOFやESI-Orbitrap型質量分析計を使用し、低分子化合物からタンパク質までの幅広い化合物の質量測定を行います。低分子化合物の定量には、LC-MS/MSを用いたMRM法で高感度かつ選択的に定量します。プロテオーム解析では、nanoLC-MS/MSを用いてタンパク質の同定や翻訳後修飾解析を高精度で行い、比較定量解析やタンパク質間相互作用解析にも対応します。
質量分析: 質量測定

MALDI-TOFやESI-Orbitrap型質量分析計を使用し、低分子化合物からタンパク質までの幅広い化合物の質量測定を行います。低分子化合物の定量には、LC-MS/MSを用いたMRM法で高感度かつ選択的に定量します。プロテオーム解析では、nanoLC-MS/MSを用いてタンパク質の同定や翻訳後修飾解析を高精度で行い、比較定量解析やタンパク質間相互作用解析にも対応します。
アミノ酸分析

高速液体クロマトグラフ（HPLC）を使用し、アミノ酸組成分析や神経伝達アミノ酸、モノアミンの定量分析を行います。最適な手法と検出器を組み合わせ、分析結果とクロマトグラムを提供します。脳透析液中のアミノ酸やモノアミン測定にも対応。ニンヒドリン法でアミノ酸成分分析、OPA法・カラムスイッチング法で神経伝達アミノ酸の定量、電気化学検出法でモノアミン分析を行います。
タンパク質精製

ゲルクロマトグラフィーシステムAKTA（Cytiva）を使用し、ペプチド抗体の精製を行います。また、生体試料（脳、細胞、血清など）から特定のタンパク質を精製し、精製データと共に返却します。さらに、組み換えタンパク質の分離をはじめ、His-tag融合タンパク、GST融合タンパク、IgG抗体、セリンプロテアーゼなどの精製にも対応可能です。これにより、研究や実験に必要な高純度なタンパク質を提供いたします。
自動細胞分取分析

セルソーターFACSAria（BD社製）を使用し、混在する細胞群から蛍光標識された特定の細胞を分取・分析し、分取した細胞を返却します。必要に応じて、蛍光顕微鏡で撮影した画像データも提供可能です。最大4種類の細胞集団を一度に分取でき、さらに一細胞解析に有用なインデックスソーティングにも対応しています。分取後の細胞の純度などは、FlowJo（BD社製）を使用してフローサイトメトリー解析を行い、結果を返却します。